Liebe Studentinnen und Studenten,
Ab September 2016 ist eine Stelle als Doktorand/in in der Arbeitsgruppe Dräger zu
besetzen. Diese Stelle wird vom US-amerikanischen NIH (National Institutes of Health)
gefördert und in einem internationalen Konsortium mit Partnern in Großbritannien und den
USA durchgeführt. Das Projekt profitiert von der engen Zusammenarbeit mit den Tübinger
Zentren für Bioinformatik (ZBIT), für Personalisierte Medizin (ZPM) sowie für Quantitative
Biologie (QBiC).
Hintergrund-Informationen:
Rechnergestützte Modellierung stellt eine der wesentlichen Säulen systembiologischer
Forschung dar. Hierbei hat sich die Modellierungssprache SBML als de facto Standard in der
Wissenschaftsgemeinde etabliert und wird von einschlägigen Wissenschaftsjournalen als
obligatorische Beigabe zu Publikationen gefordert. SBML ist Gegenstand der Ausbildung im
Bereich Systembiologie an zahlreichen Universitäten weltweit und wird von einer stetig
wachsenden Zahl von Analysesoftware unterstützt. Ein Grund für diesen Erfolg besteht in
leistungsfähigen Bibliotheken libSBML und JSBML, die vom SBML-Konsortium zur Verfügung
gestellt und kontinuierlich weiterentwickelt werden, um den wachsenden Ansprüchen der
aktuellen Forschung gerecht zu werden.
Wesentliche Ziele der Arbeit und Forschungsthemen:
* grundlegende Infrastruktur für SBML unter Java™ ausbauen und weiterentwickeln
* Entwurf von Algorithmen und Datenstrukturen
* Wissensrepräsentation
* effiziente Simulation und Modell-Kalibrierung
* Visualisierung systembiologischer Modelle
* Anwendung auf biologische und medizinische Fragestellungen
Das Angebot an Sie:
* Gelegenheit zur Promotion in Bioinformatik
* Teilnahme an internationalen Konferenzen weltweit
* Internationale Vernetzung und Zusammenarbeit in einem interkontinentalen Team
* Mitwirkung an der Gestaltung eines wesentlichen Standards der aktuellen Forschung
* 50% E13 TV-L, zunächst befristet auf drei Jahre mit Möglichkeit zur Aufstockung
Ihre Voraussetzungen:
* Master in Bioinformatik, Informatik (Biologie als Nebenfach) oder angrenzender
Disziplin
* Fundierte Kenntnisse in den Lebenswissenschaften
* Sehr gute Programmierkenntnisse mit Java™
* Kenntnisse in der Arbeit mit Datenbanksystemen und SQL
* Erfahrung mit Unix-Betriebssystemen
* Erfahrungen in der Auswertung und Analyse biologischer Datensätze
* Kenntnisse der mathematischer Modellierung
* Hervorragende Englischkenntnisse in Wort und Schrift
* Kommunikationsfähigkeit und Freude an Teamarbeit
Wie bewerben?
* Noch bis zum 1. August 2016
* per E-Mail an Dr. Dräger: andreas.draeger(a)uni-tuebingen.de
* Anschreiben
* tabellarischer Lebenslauf
* Zeugnisse beginnend mit der Hochschulreife
* ggf. Empfehlungsschreiben
Weitere Informationen:
*
http://www.cogsys.cs.uni-tuebingen.de/mitarb/draeger/vacancies/NIH-JSBML-ZB…
Frauen werden ausdrücklich zur Bewerbung aufgefordert. Schwerbehinderte Bewerber/innen
werden bei entsprechender Eignung bevorzugt eingestellt.
Mit freundlichen Grüßen
Dr. Andreas Dräger
Center for Bioinformatics Tuebingen (ZBIT), Dept. Cognitive Systems,
University of Tuebingen, Sand 1, Office #A313, 72076 Tübingen, Germany
Phone: +49-7071-29-78982, Fax: +49-7071-29-5091, twitter: @dr_drae