[Jobs] Doktorand/in: Entwicklung essentieller Software und Ressourcen für systembiologische Modellierung

Liebe Studentinnen und Studenten, Ab September 2016 ist eine Stelle als Doktorand/in in der Arbeitsgruppe Dräger zu besetzen. Diese Stelle wird vom US-amerikanischen NIH (National Institutes of Health) gefördert und in einem internationalen Konsortium mit Partnern in Großbritannien und den USA durchgeführt. Das Projekt profitiert von der engen Zusammenarbeit mit den Tübinger Zentren für Bioinformatik (ZBIT), für Personalisierte Medizin (ZPM) sowie für Quantitative Biologie (QBiC). Hintergrund-Informationen: Rechnergestützte Modellierung stellt eine der wesentlichen Säulen systembiologischer Forschung dar. Hierbei hat sich die Modellierungssprache SBML als de facto Standard in der Wissenschaftsgemeinde etabliert und wird von einschlägigen Wissenschaftsjournalen als obligatorische Beigabe zu Publikationen gefordert. SBML ist Gegenstand der Ausbildung im Bereich Systembiologie an zahlreichen Universitäten weltweit und wird von einer stetig wachsenden Zahl von Analysesoftware unterstützt. Ein Grund für diesen Erfolg besteht in leistungsfähigen Bibliotheken libSBML und JSBML, die vom SBML-Konsortium zur Verfügung gestellt und kontinuierlich weiterentwickelt werden, um den wachsenden Ansprüchen der aktuellen Forschung gerecht zu werden. Wesentliche Ziele der Arbeit und Forschungsthemen: * grundlegende Infrastruktur für SBML unter Java™ ausbauen und weiterentwickeln * Entwurf von Algorithmen und Datenstrukturen * Wissensrepräsentation * effiziente Simulation und Modell-Kalibrierung * Visualisierung systembiologischer Modelle * Anwendung auf biologische und medizinische Fragestellungen Das Angebot an Sie: * Gelegenheit zur Promotion in Bioinformatik * Teilnahme an internationalen Konferenzen weltweit * Internationale Vernetzung und Zusammenarbeit in einem interkontinentalen Team * Mitwirkung an der Gestaltung eines wesentlichen Standards der aktuellen Forschung * 50% E13 TV-L, zunächst befristet auf drei Jahre mit Möglichkeit zur Aufstockung Ihre Voraussetzungen: * Master in Bioinformatik, Informatik (Biologie als Nebenfach) oder angrenzender Disziplin * Fundierte Kenntnisse in den Lebenswissenschaften * Sehr gute Programmierkenntnisse mit Java™ * Kenntnisse in der Arbeit mit Datenbanksystemen und SQL * Erfahrung mit Unix-Betriebssystemen * Erfahrungen in der Auswertung und Analyse biologischer Datensätze * Kenntnisse der mathematischer Modellierung * Hervorragende Englischkenntnisse in Wort und Schrift * Kommunikationsfähigkeit und Freude an Teamarbeit Wie bewerben? * Noch bis zum 1. August 2016 * per E-Mail an Dr. Dräger: andreas.draeger(a)uni-tuebingen.de * Anschreiben * tabellarischer Lebenslauf * Zeugnisse beginnend mit der Hochschulreife * ggf. Empfehlungsschreiben Weitere Informationen: * http://www.cogsys.cs.uni-tuebingen.de/mitarb/draeger/vacancies/NIH-JSBML-ZB… Frauen werden ausdrücklich zur Bewerbung aufgefordert. Schwerbehinderte Bewerber/innen werden bei entsprechender Eignung bevorzugt eingestellt. Mit freundlichen Grüßen Dr. Andreas Dräger Center for Bioinformatics Tuebingen (ZBIT), Dept. Cognitive Systems, University of Tuebingen, Sand 1, Office #A313, 72076 Tübingen, Germany Phone: +49-7071-29-78982, Fax: +49-7071-29-5091, twitter: @dr_drae